Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A2P52657 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms