Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFBP49765 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms