Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIM1P49642 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms