Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBRP36941 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBRP36941 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBRP36941 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LTBRP36941 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LTBRP36941 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms