Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD13P35453 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms