Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA10P31260 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms