Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NF1P21359 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NF1P21359 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NF1P21359 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NF1P21359 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms