Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms