Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RD3LP0DJH9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms