Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN7O94888 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms