Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM2O94769 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM2O94769 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM2O94769 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms