Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms