Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms