Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC169A6NNP5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms