Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSDA5PKW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms