Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XIRP2A4UGR9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XIRP2A4UGR9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms