Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms