Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdpk1Q9Z2A0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdpk1Q9Z2A0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms