Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt71Q9R0H5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt71Q9R0H5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt71Q9R0H5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt71Q9R0H5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt71Q9R0H5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms