Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI7

Dnajb8, DnaJ homolog subfamily B member 8, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb8Q9QYI7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb8Q9QYI7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb8Q9QYI7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb8Q9QYI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnajb8Q9QYI7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajb8Q9QYI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajb8Q9QYI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajb8Q9QYI7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb8Q9QYI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajb8Q9QYI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms