Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tinf2Q9QXG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tinf2Q9QXG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tinf2Q9QXG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tinf2Q9QXG9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms