Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trp53inp1Q9QXE4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53inp1Q9QXE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trp53inp1Q9QXE4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms