Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptf1aQ9QX98 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptf1aQ9QX98 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptf1aQ9QX98 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptf1aQ9QX98 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ptf1aQ9QX98 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ptf1aQ9QX98 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptf1aQ9QX98 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptf1aQ9QX98 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms