Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc2Q9QWH1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phc2Q9QWH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc2Q9QWH1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc2Q9QWH1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms