Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chaf1aQ9QWF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chaf1aQ9QWF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chaf1aQ9QWF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chaf1aQ9QWF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms