Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,11
Tcea2Q9QVN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Tcea2Q9QVN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Tcea2Q9QVN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Tcea2Q9QVN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49,3 ms