Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tcea2Q9QVN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcea2Q9QVN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcea2Q9QVN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms