Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul3Q9JLV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul3Q9JLV5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul3Q9JLV5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul3Q9JLV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms