Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc22Q9JIG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc22Q9JIG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc22Q9JIG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms