Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgi1Q9JIA1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgi1Q9JIA1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lgi1Q9JIA1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lgi1Q9JIA1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms