Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4bQ9ES61 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ms4a4bQ9ES61 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4bQ9ES61 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms