Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc4Q9ES56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc4Q9ES56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc4Q9ES56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc4Q9ES56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms