Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a2Q9EQR4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3a2Q9EQR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a2Q9EQR4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a2Q9EQR4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3a2Q9EQR4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms