Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D8N1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D8N1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D8N1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D8N1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D8N1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D8N1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms