Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms