Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med11Q9D8C6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med11Q9D8C6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med11Q9D8C6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med11Q9D8C6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med11Q9D8C6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med11Q9D8C6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med11Q9D8C6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med11Q9D8C6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms