Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D930007J09RikQ9D2K6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D930007J09RikQ9D2K6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D930007J09RikQ9D2K6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms