Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necap2Q9D1J1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necap2Q9D1J1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms