Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D131 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D131 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D131 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D131 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D131 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D131 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D131 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D131 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D131 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D131 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D131 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D131 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D131 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D131 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D131 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D131 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D131 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D131 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D131 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D131 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D131 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D131 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D131 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D131 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D131 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D131 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D131 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D131 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D131 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D131 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D131 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D131 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D131 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D131 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D131 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D131 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D131 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D131 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D131 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D131 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D131 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms