Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Malsu1Q9CWV0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Malsu1Q9CWV0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms