Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Khdc3Q9CWU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Khdc3Q9CWU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Khdc3Q9CWU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Khdc3Q9CWU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Khdc3Q9CWU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Khdc3Q9CWU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms