Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd12Q9CWU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd12Q9CWU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd12Q9CWU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms