Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx2Q9CWK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx2Q9CWK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx2Q9CWK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx2Q9CWK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx2Q9CWK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms