Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd4Q9CPR1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd4Q9CPR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd4Q9CPR1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd4Q9CPR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd4Q9CPR1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms