Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clp1Q99LI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clp1Q99LI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clp1Q99LI9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clp1Q99LI9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms