Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnajb11Q99KV1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnajb11Q99KV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dnajb11Q99KV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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