Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def8Q99J78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def8Q99J78 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def8Q99J78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Def8Q99J78 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Def8Q99J78 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Def8Q99J78 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Def8Q99J78 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Def8Q99J78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms