Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PxnQ8VI36 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PxnQ8VI36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PxnQ8VI36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PxnQ8VI36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PxnQ8VI36 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms