Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BbxQ8VBW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BbxQ8VBW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BbxQ8VBW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms