Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Shtn1Q8K2Q9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Shtn1Q8K2Q9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shtn1Q8K2Q9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shtn1Q8K2Q9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shtn1Q8K2Q9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shtn1Q8K2Q9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms