Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atad2Q8CDM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atad2Q8CDM1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atad2Q8CDM1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atad2Q8CDM1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atad2Q8CDM1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atad2Q8CDM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atad2Q8CDM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atad2Q8CDM1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms